La majeure partie des financements de Notre Abri provient des subventions de l’Office de la naissance et de l’enfance (ONE), organisme public belge chargé des pouponnières. Cette enveloppe, d’un montant de 1,465 million d’euros en 2022, se révèle insuffisante pour le coût des deux principaux postes : le personnel (1,643 millions) et des frais de fonctionnement (294 000 €). Le déficit structurel (350 000 €) est comblé par des donations privées ou d’entreprises.
Chaque année, des événements sont organisés par le directeur et le conseil d’administration pour favoriser le mécénat autour de projets précis, comme la rénovation des bâtiments ou la création de l’école « L’Escalade ». En 2022, par exemple, une séance d’enchères et un spectacle ont été imaginés pour inciter aux dons. En octobre, une course de vélo des mécènes a permis d’engranger presque 100 000 €.