Les directeurs de la protection judiciaire de la jeunesse (PJJ) recrutés par la voie de concours et ceux promus au choix après inscription sur une liste d'aptitude bénéficient, pendant la durée de leur stage, d'une formation. Laquelle, organisée par le Centre national de formation et d'études de la PJJ, est refondue par un arrêté.
Fondée sur le principe d'alternance entre des regroupements et des stages, cette formation vise à favoriser « l'acquisition d'une identité professionnelle et à garantir la maîtrise d'outils et de méthodes pour diriger et animer un établissement ou un service éducatif ».
Elle comprend deux phases de 20 semaines : la première a lieu sous forme de regroupements dont les objectifs sont de faciliter « l'intégration des enjeux particuliers à la fonction et aux missions de l'institution et l'acquisition et le développement de compétences dans l'animation technique et pédagogique, la gestion des ressources humaines et l'organisation, l'administration et la gestion d'un établissement ou service » ;la seconde - un stage dans un établissement ou service de la PJJ - est une mise en situation progressive de responsabilité.
La titularisation à l'issue de l'année de stage a lieu après validation par le jury au vu des trois notes obtenues par le stagiaire (sur son dossier de formation, son stage ainsi que la présentation et la soutenance d'un travail personnel) suivant des modalités qui sont modifiées.